构造 · 从目标位姿到可交付结构
给定模板与目标位姿，走「6-DOF 位姿 → 全原子闭合 → OpenMM 收尾」三步， 得到一份带指标、带边界、可复算的结构。下面用 AdK（4AKE → 1AKE）做演示： 拖动滑块看模板如何被构造成目标，右侧是收尾后的真实读数。
灰＝静态段（切点前）｜青＝运动段（切点后）｜淡点＝目标位姿（对齐后）。 切点 pos 0.52（残基 112）；坐标已叠合到模板。
能否在线计算？
分三档：能放进浏览器的、必须放后端的、以及现在不建议在线做的。Cloudflare Pages 只能跑 JS （Pages Functions 也是 Worker，128 MB / 30 s），Python＋OpenMM 必须放到容器服务。
① 浏览器预检 可上线
上传 PDB ＋ 选目标角/轴，前端算：CA 角、跨段/全链冲突、断口距离、可行带。 3000 原子用 JS KD-tree 约几十毫秒，不需要后端。
给什么：能不能造、代价几对、哪几个残基要改。
② 排队构造 需后端
FastAPI ＋ Biopython ＋ OpenMM 容器（Fly.io / Render / RunPod）。 上传 → job id → 轮询 → 下载；单例 1–3 分钟。
给什么：全链 0 的结构、gap、RMSD、复算包。
③ 站内全流程 不建议
Pyodide 能跑 numpy 版几何，但跑不了 OpenMM；浏览器里做“收尾”会又慢又不稳。 全流程放容器，网站只做提交与展示。
建议顺序：先上 ①（纯前端、当天可用），再上 ②（一个容器＋队列＋配额）。 ③ 只作为离线批处理，不放进浏览器。