KE几何地形

在线预检 · 这个目标构象造不造得出来

上传一个 PDB,选切点与目标角,浏览器本地算:能不能到目标角、断口多大、跨段新增多少对冲突。 不上传服务器、不装任何东西;这一步只做几何预检,不做 OpenMM 收尾。

0.50
60°
达成角—目标 60°
断口 C–N—Å(标准 ~1.33)
跨段新增冲突—对(2.5 Å)
全链新增冲突—对(含段内)

等待上传 PDB。

跨段新增冲突:绿=0,红=多

口径与边界

预检=刚性旋转运动段(绕切点 CA)+ 几何计数:角度用两段 CA 主轴夹角;冲突为 2.5 Å、排除 |Δres|≤1; “跨段”只数切点两侧,“全链”含段内。断口是 C(cut−1)–N(cut) 距离。
不做:骨架重建、侧链重排、OpenMM 收尾、能量。预检说“能”,不等于交付结构;说“不能”,才是省时间的那一步。