◈ KE几何地形

合法见证

给定一组硬约束,给一个可独立检查的构型;不排名、不打分、不承诺唯一。
不是“最好的结构”,是“在这组约束下合法的见证”。

约束先于答案

锚点、接触、核心避让、键几何、手性——先说清硬约束,再谈构型。

见证可检查

约束列表 + 构型 + 检查器版本;任何第三方拿三样东西就能复核。

三态,不二值

可行 / 不可行 / 不可判。找不到不等于不存在。

三态

判定含义例子
feasible存在满足全部硬约束的见证loop 闭合:gap 1.33 Å,核心冲突 0
infeasible硬几何可证不存在锚点弦长 > 链长可达上限
undecidable段族不完备 / 搜索未覆盖稀疏距离的 DG:约束不足

见证证书 ke-witness/1

每个结果附带:约束、见证 SHA256、检查项、三态、边界。

{
  "schema": "ke-witness/1",
  "problem": { "segment": [188, 198], "family": "closure" },
  "verdict": "feasible",
  "witness": { "file": "witness.pdb", "sha256": "…" },
  "checks": {
    "anchor_err": 0.0,
    "contact_err": [],
    "core_contacts": 0
  },
  "boundary": ["CA-level witness", "no scoring; legality only"]
}

校验:kemol verify --cert cert.json --pdb witness.pdb

浏览器校验证书

下面这份证书由 kemol dg 生成;页面用 WebCrypto 重算见证的 SHA256,与证书比对。

未校验

实测(不是示意)

用例判定关键读数
1AKE loop 闭合(2.95 Å 断口)feasiblegap 1.33、核心 0
DG patch(全对距离)feasible距离误差 0.045、局部 0.02 Å
AQ4 配体口袋feasible接触 0/0/0、核心 0
看边界与验证 →
English summary

A legal witness is a concrete configuration that satisfies a declared set of hard constraints. We report feasible / infeasible / undecidable; we do not rank or score. Each result carries a ke-witness/1 certificate with constraint list, witness SHA256, checks and boundary.